禽肺炎病毒(APV)主要引起鸡上呼吸道的症状,以喷嚏,眼结膜潮红,泪腺肿,明显的症状为头部出现皮下水肿,出现头部肿大。SYBR Green I 实时荧光定量RT-PCR技术具有操作简便、结果直观、敏感性高、特异性强、重复性好等优点。建立一种SYBR Green I 实时荧光定量RT-PCR技术检测APV,能特异检测APV,检测的限量为10个拷贝的APV。
本发明通过Primer Express3.0软件,设计扩增禽肺炎病毒的引物,通过比对分析设计的引物之间的二聚体、发夹结构等,最终设计出了1对引物。建立了禽肺炎病毒的SYBR Green I实时荧光定量RT-PCR方法。该方法无需进行电泳,仅需要约30分钟的时间完成扩增,并且可以直接通过电脑来观察反应结果,而常规的RT-PCR方法起码需要3.5小时来完成扩增反应,然后需要花2小时进行凝胶电泳来观察结果。
2)检测敏感性高
建立的SYBR Green I实时荧光定量RT-PCR方法对样品中禽肺炎病毒的含量进行定量,其检测的灵敏度非常高,能检测到限量为10个拷贝的禽肺炎病毒质粒,常规PCR为1000个拷贝,检测结果比常规PCR方法敏感。用该的技术建立的试剂盒可用于禽肺炎病毒的鉴别检测,对禽肺炎病毒的准确诊断和预防有重要意义。
3)检测简便,价格相对较低
采用SYBR Green I实时建立的荧光定量PCR方法,是在缓冲液中加入SYBR Green I结合扩增时出现的双链,达到检测的目的。在扩增时形成的引物二聚体会影响检测结果,因此要进行溶解曲线分析,对扩增条件进行优化,消除引物二聚体的产生。采用SYBR Green I荧光染料的方法,要比Taqman探针方法简便,价格相对较低。